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水口 賢司 (Kenji Mizuguchi Ph.D.)

博士(理学)

大阪大学蛋白質研究所 教授


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略歴

  • 1990年 京都大学理学部卒業
  • 1992年 京都大学大学院理学研究科(化学専攻)修士課程修了
  • 1995年 京都大学大学院理学研究科(化学専攻)博士課程修了 博士(理学)
  • 1995年 ロンドン大学バークベック校結晶学科 客員研究員(日本学術振興会特別研究員)
  • 1996年 ケンブリッジ大学生物化学科 HFSP長期フェロー
  • 1998年 ケンブリッジ大学生化学科 博士研究員
  • 2000年 ケンブリッジ大学生化学科 グループリーダー(Wellcome Trustフェロー,独立研究室主宰)
  • 2004年 ケンブリッジ大学理論物理/応用数学科 University Lecturer(生化学科兼任)
  • 2006年 国立研究開発法人 医薬基盤・健康・栄養研究所 プロジェクトリーダー(-2024)
  • 2007年 大阪大学大学院生命機能研究科 招へい教授 (-2024)
  • 2015年 大阪大学大学院薬学研究科 招へい教授 (-2024)
  • 2019年 AI健康・医薬研究センター(ArCHER) センター長(併任 -2024)
  • 2019年 大阪大学蛋白質研究所 教授(現職)

主な研究分野

創薬に向けたバイオインフォマティクス研究
主要業績

アミノ酸配列のみからのタンパク質立体構造予測法の開発

  • FUGUE
  • CASP国際ベンチマークなどで高評価
  • 多くの利用例(JMB 2001; 論文引用数>1400)
  • Tripos社との連携による製品化

大規模データ解析とデータ統合、データベース開発

  • TargetMineー創薬ターゲットの絞り込みを支援する統合データウェアハウス
  • ToxyagtesーLinked Dataと大規模マイクロアレイデータを統合したトキシコゲノミクスオンライン解析システム
  • HOMSTRADータンパク質立体構造アラインメントの先駆的データベース

タンパク質の構造、機能や相互作用の解析と予測の成功(実験による検証)

  • 発生過程の制御因子、病原性バクテリアの代謝酵素、がんや神経疾患に関与する新規因子その他
  • TargetMineを用いた、C型肝炎や他の疾患に関与する新規因子の同定と実験による証明
  • PSIVERを用いて予測した相互作用部位ペプチドによる、相互作用の特異的な阻害と乳癌細胞の増殖抑制
共同研究

競争的資金

こちらの詳細ページをご覧ください。

教育業績

ケンブリッジ大学生化学科(2000-2006)

  • 学部学生、卒業研究室受入(2000-2006;成果PMID: 12016060, 16648940)
  • 学位授与3名

ケンブリッジ大学理論物理/応用数学科(2004-2006)

  • Master’s programme in Computational Biology(2004-2006)‘Structural Biology’モジュールのコーディネーター(講義、実習、評価)

大阪大学大学院招へい教授(2007-2024)

  • 学位授与4名(生命機能研究科、薬学研究科)

大阪大学教授(2019-)

担当科目 (researchmap)

委員等

  • 内閣府「個別化医療に向けた次世代医薬品創出基盤技術開発」評価検討会 委員
  • 総務省国際戦略局技術政策課SCOPE事務局 専門評価委員
  • 総合科学技術・イノベーション会議評価専門調査会「個別化医療に向けた次世代医薬品創出基盤技術開発」フォローアップ検討会 委員
  • 文部科学省新学術領域研究専門委員会 委員
  • 日本学術振興会科学研究費委員会(第二段審査)委員
  • 日本学術振興会 回折構造生物第169委員会
  • 国立研究開発法人日本医療研究開発機構 課題評価委員
  • 国立研究開発法人科学技術振興機構 ライフサイエンスデータベース統合推進事業 研究アドバイザー
  • 日本バイオインフォマティクス学会 評議員
  • CBI学会 評議員
  • 日本生物物理学会 分野別専門委員

論文発表

原著論文(researchmap)

総説、コメンタリーなど(researchmap)

書籍など(researchmap)

引用指標(Google Scholar)

ポストプリント(OUKA)

ビデオ

InCoB2018 Keynote Speaker Highlight
【YouTube配信】第13回ケムステVシンポ

キャリアパス紹介

CBI学会誌第11巻第3号